福海县境自古为多发族共同生存发展区域。约公元前五世纪至清代，在此生活过的有塞人、呼揭、匈奴、鲜卑、柔然、突厥、葛逻禄人以及蒙古、汉、哈萨克族等。公元前60年，西域都护府的设立全使本增正式纳入祖国版图。在历史演进过程中，县境曾先后隶属部族地方政权突厥汗国、铁勒汗国、蒙古汗国、瓦剌汗国、准噶尔汗国辖理。盛唐时期，县境分属于唐王朝的羁縻政权大漠、阴山都督府管辖，元代属别失八里省。清代，县境以乌伦古河为界南北分属于伊犁将军府和乌里雅苏台定边左副将军治下的科布多参赞大臣管辖。清同治年间，曾设布伦托海办事大臣辖理相当于今阿勒泰地区范围的广大地区，治所据传就在今县城西（遗址待考），布伦托海一时成为阿尔泰大草原政治、经济、文化中心。光绪年间，清廷设布伦托海屯局。光绪三十一年（1906），科（科布多）、阿（阿尔泰）分治，县境归阿尔泰办事大臣管辖。阿尔泰办事大臣所辖区域直隶于清廷理蕃院，属中央特别行政区。民国8年（1919），正式建县，名布伦托海县（布伦托海，蒙古语，意为杂色丛林），民国31年（1942）改称福海县。